Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms