Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms