Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr1O55100 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms