Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms