Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlkO54988 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlkO54988 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlkO54988 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlkO54988 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlkO54988 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SlkO54988 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlkO54988 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SlkO54988 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlkO54988 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlkO54988 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlkO54988 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms