Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LatO54957 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LatO54957 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LatO54957 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms