Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole2O54956 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms