Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6bO54951 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6bO54951 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms