Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb3O54890 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms