Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rem1O35929 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rem1O35929 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms