Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rabep1O35551 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rabep1O35551 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabep1O35551 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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