Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk4O35493 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk4O35493 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk4O35493 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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