Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf5O35445 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf5O35445 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf5O35445 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf5O35445 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf5O35445 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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