Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KeraO35367 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KeraO35367 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KeraO35367 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KeraO35367 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KeraO35367 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KeraO35367 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KeraO35367 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KeraO35367 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KeraO35367 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KeraO35367 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KeraO35367 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KeraO35367 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KeraO35367 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KeraO35367 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms