Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna3O35344 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms