Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms