Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf5O35326 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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