Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2O35245 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms