Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad6O35182 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad6O35182 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms