Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Polr1aO35134 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1aO35134 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms