Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ArxO35085 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArxO35085 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ArxO35085 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ArxO35085 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ArxO35085 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ArxO35085 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ArxO35085 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms