Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Q1O19441 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Q1O19441 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms