Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Casq1O09165 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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