Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MttpO08601 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MttpO08601 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MttpO08601 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MttpO08601 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MttpO08601 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MttpO08601 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MttpO08601 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MttpO08601 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MttpO08601 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms