Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna5O08543 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efna5O08543 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna5O08543 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms