Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3424L7N298 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3424L7N298 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms