Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms