Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3248K7N721 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3248K7N721 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3248K7N721 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3248K7N721 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm3248K7N721 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3248K7N721 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3248K7N721 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3248K7N721 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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