Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer2J3QPU5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms