Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alkal1J3QPP8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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