Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm2035J3QP87 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2035J3QP87 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm2035J3QP87 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm2035J3QP87 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm2035J3QP87 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms