Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5294J3QP53 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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