Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3415J3QMS8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
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