Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700014D04RikJ3QMS2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms