Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm20873J3QMQ9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20873J3QMQ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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