Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp870J3QMA4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zfp870J3QMA4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms