Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930544D05RikJ3QK56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930544D05RikJ3QK56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms