Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms