Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms