Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r12G5E8G1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms