Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef1G3X9K3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef1G3X9K3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms