Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubap1lG3UW59 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubap1lG3UW59 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms