Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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