Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms