Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms