Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Igkv1-99F6XWB2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms