Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Crocc2F6XLV1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Crocc2F6XLV1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms