Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6619F6URP1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms