Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28305F6U473 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms