Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm340F6RGI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms